為兼顧地下水保育與民眾生計，臺南市政府水利局辦理九十九年八月四日前鑿設的既有水井申報納管作業，去年開始公告受理申報作業，迄今數量已突破二點七萬口；市長黃偉哲提醒申報期限至八月二日截止，逾期經查獲者將要求限期封填與處罰，尚未申報納管者把握機會。

水利局長邱忠川表示，水井納管除可保育地下水資源，接受輔導合法取得水權後亦可獲得合法用水保障，配合中央修正水權登記收費標準，納管後灌溉、養殖及畜牧等農業用水水井可免收各項水權登記規費；為讓市民了解水井納管計畫，陸續召開卅七區民眾先期政策說明會，並對養殖、畜牧團體、工業區等辦理先期政策說明會傾聽民意。

邱忠川指出，為方便民眾申報，水利局建置多元受理申報管道，各區公所櫃台均備有申報書，填妥後可投遞於區公所水井納管收件箱，或利用手機下載臺南市水井納管APP申報或至水利局官網點選「民生—水井納管申報」，另也設置水井納管專線，由專人提供解說服務。