实践大学教授蔡政安表示，台湾在1996年举行首次总统普选，只要在选举期间不表态或支持非执政党候选人的团体，都遭秋後算帐；当时遭殃的至少有佛光山、中台山惟觉老和尚、悟觉妙天禅师、太极门与宋七力等。太极门人权迫害案於2007年已获刑事三审判决确定无罪、无税、无违反税捐稽徵法，认定敬师礼为赠与；但仍遭国税局持续违法强徵课税，2020年太极门的修行圣地更被违法收归国有。

蔡政安指出，转型正义的核心目标是揭示过去不公义和侵犯人权的真相，并寻求正义、和解与补偿，但台湾仍存在「转型正义的时间限制性」与「新证据的时效限制性」的威权馀毒，加上没完没了的「万年税单」，三者残存威权馀毒的政经体制，成为妨碍修正过去错误的关键。他诚挚呼吁台湾政府正视威权馀毒的存在，落实转型正义，平反太极门人权迫害案，提升台湾宗教信仰自由与人权的国际水准。

太极门弟子方南茵指出，太极门是古传气功武术修行门派，师徒代代相传。凡入门者都须要经过二位门内弟子推荐及师父首肯，并经入门古礼及宣誓，再呈上敬师礼，入门之後就是「一日为师，终身为父」。在台湾上万个武术、气功、宗教修行团体，从没有一个被当成补习班课税，却独对太极门为之，难道不是刻意对太极门歧视打压？她表示，28年来，因为遵循师父的叮嘱，弟子们坚持真理，追寻正义至今。习武之人不畏迫害，执起心中的剑，她相信正义终将到来。

来自东京日本家庭联盟的Yuzaburo Nagasaka听完太极门案感到非常震惊，因为台湾应该是自由和民主的。他认为，不仅是宗教，很多艺术、文化、传统和舞蹈都有师徒制度，这是基本的，像歌舞伎等都有这种传统。他不认为这在日本会有此争议，因为师徒关系已经发生了几百年了，这是很自然的。
台湾政府自诩为亚洲民主灯塔，却仍无法调整过去错误，对国际人权学者的质疑，也没有积极回应。Claudia Huang在北马其顿和蔡政安在日本发表的文章，均获得美国最大的宗教大学，也是美国研究宗教相关法律最知名的研究中心 - 杨百翰大学的国际法律与宗教研究中心推选为当日的推荐文章，显见国际上对太极门案件的关注已日渐提升，台湾政府怎能再消极以对？