南投县府卫生局为守护乡亲健康，一一四年一月一日起推出四项保健防疫政策，提高县民的健康及防疫保护。包括无痛大肠镜检、流感疫苗接种、新冠疫苗接种及肠病毒疫苗接种等。

无痛大肠镜检∶对象五十岁以上县民且於一一三年十月一日至一一四年九月三十日进行公费定量免疫法粪便潜血检查後结果为疑似异常的民众。补助内容∶对符合条件的民众提供无痛大肠镜检查所需的麻醉及清肠药物费用补助。民众只需持健保卡和身分证至指定医疗机构，相关费用将全额由县政府支付。

扩大5类癌症筛检∶子宫颈抹片检查∶二十五至二十九岁女性∶每三年一次；三十岁以上女性∶每年一次；乳房X光摄影检查∶四十至七十四岁女性∶每二年一次。定量免疫法粪便潜血检查∶四十五至七十四岁民众∶每二年一次；四十至四十四岁且有直系亲属（父母、兄弟姐妹、子女）曾患大肠癌者∶每二年一次。

公费流感疫苗接种开放全民接种∶流感疫苗开放给满六个月以上的民众接种，直至疫苗用罄为止。呼吁全家一起接种流感疫苗，保障健康过年。

全国唯一肠病毒71型疫苗接种∶对象为设籍南投县且出生满二个月至未满六岁的低收入及中低收入户婴幼儿，每位幼童需接种2剂疫苗。