对於某媒体投书指称内政部主管湿地破坏遭受践踏，内政部国家公园署澄清，依据湿地保育法目前划设五十九处重要湿地，包含二处国际级，四十处国家级，十七处地方级，面积共有四万二七三○公顷。这些重要湿地均依法拟定保育利用计画，进行湿地环境保育及明智利用项目管理，没有所谓光电设置践踏珍贵湿地情形。一一三年国内出现黑面琵鹭数量，也较一一二年同期呈现增加趋势，并无减少状况。

国家公园署表示，湿地保育法施行以来，从来没有允许於国内其他重要湿地设置任何绿能设施。该文所指嘉义布袋、台南七股、高雄永安等盐田设置光电场区域，均非依法划设重要湿地范围。而先前曾配合桃园农业博览会新屋农博环境教育园区设置，同意於桃园新屋十二__十四号池（属桃园埤圳重要湿地）设置示范光电设施，也属示范性设施，并严格监控管制。

此外，内政部也非绿能设施主管机关，该文宣称国家公园署原本规划嘉义、台南共八百公顷盐滩地搭建光电板一事绝非事实。

国家公园署说明，目前最新黑面琵鹭调查资料显示，截至一一三年十二月国内出现三二○五苹，相较一一二年同期增加一七六苹，相较前次调查也增加一二五苹，没有湿地设置光电造成数量减少情形。国家公园署强调，如果在重要湿地或其保育利用计画范围内，发生破坏生物洄游通道及野生动植物繁殖区或栖息环境等行为，将立即依湿地保育法裁罚，吁各界共同守护珍贵湿地环境。