0121楠西地震發生至今，臺南市政府工務局積極處理紅、黃單危險建築物緊急評估、損壞評估、補助審核等相關事宜，市府並成立「震災復原聯合服務中心」，提供受損戶相關即時資訊；工務局表示，自3月13日首筆補助款入帳迄今，受理修繕或拆除重建補助603件，自3月13日首筆輔助款入帳至今已核撥344件，件數近六成，撥款金額逾1億元，也提醒尚未申請的民眾儘速申請。

南市工務局指出，震災紅、黃單補助金額由建築師、土木技師及結構技師等三大專業公會現勘，總計房屋損壞評估4122件建築物，損害評估受理1983件，已全數完成，陸續寄出評估報告、修繕或拆除重建補助金額及補助申請書；為便利災民就近申辦，市府採「單點申請，專人送件」的機制，可讓民眾免於四處奔波申請各式佐證文件，提醒尚未申請的民眾儘速帶著申請書、身分證影本、金融機構存摺影本、損害評估報告正本、領據、建物權利證明文件及切結書等資料向所在地區公所申請。

工務局也進一步說明，為擴大災後照顧範圍，加速建築物內附屬設施、設備修繕，包括水管破裂、天花板、門窗、化糞池毀等，減少民眾生活不便，市府即將公告「一般住宅建築物災損修繕救助金實施計畫」，只要區公所有緊急通報列冊的都可以申請修繕補助。

工務局強調，此次地震也震出「大樓軟腳蝦」問題，玉井文化大廈於地震中受到相當嚴重損害，為讓30間住戶能夠儘早返家，工務局28日也舉辦震後復原方案說明會，邀國震研究中心、國土署等派員說明，希望能夠以0206及0403等地震案例，向住戶說明「弱層補強」好處，提供專業建議，協助住戶以最快速的時間，早日重返家園。