内政部国家公园署表示，东沙环礁海洋生态资源极为丰富，惟中国大陆渔船不断越界捕鱼，破坏海洋生态及资源，为进一步遏止大陆渔船非法滥捕，该署近期与海洋委员会海巡署紧密合作，强化巡逻与执法量能，加速驱离违规船苹，避免生态资源流失。

国家公园署表示，所属海洋国家公园管理处将以研究小艇，在礁台区发挥吃水较浅的优势，协同海巡署执行海域查缉工作，有效破除中国渔船以母船带小船作业方式。一一四年度海管处再增购一艘研究小艇，除了平时的海域保育研究工作，也可适时的协同海巡，强化联合执法量能。

另外界关注开放东沙旅游，国家公园署表示，东沙环礁生态敏感独特且环境脆弱，太多人为活动会增加生态环境压力。相关政策必须充分考量生态与环境影响因素，并以「生态优先」为原则，因此东沙环礁开放旅游仍处於审慎评估阶段。

国家公园署强调，海洋国家公园是人类共同的珍贵资产，海洋保育是一场长期战役。东沙环礁孤悬外海，必须跨机关共同合作，加强协同执法，才能遏止违法采捕，以维护国家公园的珍贵生态。