「脑血管疾病」是全世界高居第二位的死因，於九十四年开始已经成为国人十大死因的第四名；脑血管疾病是多种慢性疾病中，造成病人生活功能丧失的主要疾病，大约55%的脑血管疾病生还者可能存在各种轻重程度不等的失能或残障，不仅对病人个人生命和工作严重打击，而且国家、社会或家庭也都必需付出很大的人力和财力来照顾脑血管疾病的病人，因此对脑血管疾病积极的治疗是每位医师的职责。

高雄荣民总医院对於脑血管疾病的治疗成立了「脑中风中心」，不仅在初期有西医快速的诊断、对於脑梗塞类型的病人在适当的期限内以血栓溶解剂和先进的血管取栓术治疗患者，後续住院的复健照护也都加上了中医的多元治疗，让患者有更好的全面照护。

高雄荣总传统医学科在脑血管疾病的病人住院期间根据「全民健康保险西医住院病患中医特定疾病辅助医疗计画」在发病起六个月内之住院期间，可用健保给付来会诊，不用自费治疗，为有需要病人减少医疗支出；该科在脑血管疾病的中医会诊每年有超过四千人次的治疗，在治疗成效上有不错成绩，以「巴氏量表」及「NIHSS」的功能评估上，分数皆有显著进步；病人一年死亡率及整体死亡率在中西医共同治疗下也有显著的下降。

脑血管疾病的病人出院後，高雄荣总传统医学科承办「特定疾病门诊中医加强照护计画」，针对了脑血管疾病自诊断日起二年内之患者进行疾病门诊加强照护，依每位病人的病情，拟定的中医治疗方针，提升病人的康复速度与生活品质；对於无法到院门诊就医的脑血管疾病的病人，高雄荣总传统医学科有参与「全民健康保险居家医疗整合计画」，由中医师至病人家中提供医疗服务，透过中医药、针灸、伤外科等治疗来缓解病痛。