湿地具有调节气候、涵养水源、滞洪防灾及净化水质等功能，尤其近年来，全球因受温室气体排放及暖化影响，涝、旱灾频次增加，民众对於滞洪防灾及净化水质高度重视，亦显示湿地保育的重要性，且湿地具有丰富的生物多样性，也是重要的生物基因库及繁衍栖息地。国家公园署指出，为了达到湿地保育的目标，推广湿地环境教育必须普及民众对於生态保育的认知，强调爱惜生态资源以及维护自然环境对永续生活的重要性。

依据《湿地保育法》第四条，湿地系指天然或人为、永久或暂时、静止或流动、淡水或咸水或半咸水之沼泽、　湖、泥煤地、潮间带、水域等区域，包括水深在最低低潮时不超过六公尺之海域。例如东沙环礁国家公园其西侧　湖口周边区域拥有大面积的海草床，提供尖嘴柠檬鲨生育环境，是柠檬鲨族群最重要的育幼场，且已知为全球仅有！更是南海唯 一记录到幼鲨、小鲨稳定出没的区域。每年怀著宝宝的尖齿柠檬鲨母鲨，都会回到曾经孕育它、陪伴它成长的栖地，彷佛回到令它最安心的娘家，待产、生下幼鲨，将这片最好的栖地交给下一代。

《湿地保育法》第八条规定重要湿地分为国际级、国家级及地方级三级。国家公园署副署长陈贞蓉表示，截至一一三年底，我国重要湿地包含国际级重要湿地两处（曾文溪口湿地、四草湿地）、国家级重要湿地四十处、地方级重要湿地十七处，及暂定重要湿地二处。国家公园署指出，被列为「国际级重要湿地」之一的曾文溪口湿地，是濒危物种黑面琵鹭每年来台渡冬栖息及觅食的重要场域，深受全球鸟类保育人士瞩目。此外曾文溪出海口还有约二百多种候鸟，鸟类资源相当丰富，每年亦吸引众多赏鸟人士前来朝圣。

由於湿地保育及维护生物多样性的重要性，要如何做好湿地保育？专家指出可从以下著手∶一、自然湿地应优先保护，并维系其水资源系统。二、加强保育湿地之动植物资源，不骚扰湿地内之雀鸟，不采摘任何在湿地生长之植物。三、具生态网络意义之湿地及湿地周边环境和景观，应妥善整体规划及维护。四、配合湿地复育、防洪滞洪、水质净化、水资源保育及利用、景观及游憩，推动湿地系统之整体规划。必要时，得於适当地区以适当方式辟建人工湿地。