黃坤光認為，很多稅額核定以追求最高稅收為目標，卻忽略了市場運作規則，結果造成了不合理的稅負。如存貨無法銷售，仍被核定為已獲取最高利潤，甚至對虧損企業課徵不實稅額，完全違反經濟常識與公平原則。再者，推計課稅的機制過於偏頗，如將收入按市場最高價核定，成本則按最低價核定，不平衡的做法完全偏向稽徵機關。此類不當核課常導致納稅人很難提出有效救濟，造成嚴重的不公平。他強調稅務制度改革，應回歸依法課稅與公平原則，而非僅為便利稅務機關而設計。

為何全世界只有台灣才有「萬年稅單」的怪現象？

李念祖律師曾於理律法律事務所舉辦法治稅制系列研討會中直指，行政法院法官沒有終判的權力意識，只有秩序意識，把「撤銷另為處分」當作基本動作，造成全世界只有台灣才有的「萬年稅單」現象，並對現今行政法院心態提出強烈的質疑：「打完行政訴訟還可以重新調查，這要行政訴訟制度幹甚麼？」
李念祖也指出萬年稅單的矛盾點，如果原處分是100元，復查決定是98元，行政法院判決只撤銷復查決定98元，卻不撤銷原處分100元，難道是要人民打贏了行政訴訟，卻要付更多稅嗎？這樣道理不通。「司法思考行政機關做的對或不對，是從保障人權角度；司法尊重行政，並不是行政權所做的事情，司法不能裁決。」李念祖認為，司法機關最值得做的是判斷行政機關到底對不對，最重要的功能是保障人民權利，不然根本不需要行政法院，我國法治國家權力分立就會化為烏有。